実写化ドラマ第２弾。 高校生探偵・工藤新一には前作に引き続き、実力・人気ともに若手俳優ＮＯ．１の小栗旬が扮し、自身が「これが最後」と語る制服姿を披露。原作者・青山剛昌が"恋する名探偵"と評する工藤新一を華麗に演じ、その姿は原作ファンをも魅了した。 新一の幼なじみ・毛利蘭は黒川智花、毛利小五郎には陣内孝則が前作に続いて出演。また原作でもストーリーの大きな縦軸として連載スタート時から注目されている"黒の組織"がついに登場。ジン役に佐々木蔵之介、組織から逃げるために自ら毒薬を飲み灰原哀と名乗ることになったシェリーこと宮野志保を香椎由宇が好演。
黒の組織に毒薬を飲まされ、体が小さくなってしまった高校生探偵の工藤新一は、江戸川コナンと名乗って身を隠し、黒の組織の情報を追っていた。彼の正体を知っているのは阿笠博士（田山涼成）と、同級生の灰原哀だけ。実は哀は黒の組織の一員・宮野志保（香椎由宇）で、新一の体を小さくした毒薬の開発者だった。だが姉を殺され、組織から逃げるため自らその薬を飲み、小学生の哀として身を隠していたのだ。彼女は密かに解毒剤の研究を続けていた。 鈴木財閥が新しいホテルを完成させ、その披露記念として「ミス・ジャパネスク受賞祝賀パーティー」を行ない、生中継されることになった。友人である鈴木財閥の娘・園子に招かれたコナンと、新一の同級生で、探偵・毛利小五郎（陣内孝則）の娘・蘭、阿笠博士、哀も招待客として出席していた。そんな中、ミス・ジャパネスクの寿かれんに脅迫状が届く。かれんの姉でマネジャーの美々（西尾まり）は不安を募らせる。不安を覚える蘭は、新一の携帯に助けを求めるメッセージを入れる。一方、会場でケーキを食べたコナンと哀の体に異変が起こる。ケーキには、一時的に体が元に戻るある種のアルコール成分が含まれていたのだ…。
